Flavonoid secara luas didistribusikan pada tanaman memenuhi banyak fungsi.

Flavonoid merupakan pigmen tumbuhan yang paling penting untuk pewarnaan bunga memproduksi pigmentasi kuning atau merah / biru di kelopak dirancang untuk menarik hewan penyerbuk.

Pada tumbuhan tingkat tinggi, Flavonoid terlibat dalam filtrasi UV, fiksasi nitrogen simbiotik dan pigmentasi bunga.

Mereka dapat bertindak sebagai utusan kimia atau regulator fisiologis, mereka juga dapat bertindak sebagai inhibitor siklus sel.

Flavonoid disekresikan oleh akar tanaman inang rhizobia mereka bantuan dalam tahap infeksi hubungan simbiotik mereka dengan kacang-kacangan seperti kacang polong, kacang-kacangan, semanggi, dan kedelai. Hidup rhizobia dalam tanah dapat merasakan flavonoid dan ini memicu sekresi faktor Nod, yang pada gilirannya diakui oleh tanaman inang dan dapat menyebabkan akar rambut dan deformasi tanggapan beberapa seluler seperti fluks ion dan pembentukan bintil akar .

Selain itu, beberapa flavonoid memiliki aktivitas penghambatan terhadap organisme yang menyebabkan misalnya penyakit tanaman Fusarium oxysporum